康熙帝看到鳌拜这副情形，于是有意识处理，阴令给事中张是红等联衔奏请。贝勒王大臣相同的声音赞成，只有鳌拜不发一词。康熙帝又延长了时间，直到康熙六年秋季，开始到乾清门听政。隔了几天，索尼疾病消失，鳌拜想加专横，苏克萨哈恐怕不能免于灾祸，于是呈上奏折，大意是说：
我用薄材，受到先帝不次的提升，厕所进入辅臣之列，七年以来，毫没有报告称，罪状很多。正遇上皇帝亲自大政，祈请让我去守先皇帝陵墓，如线多休息，得以保全生命，那么我报答皇上养育之恩，也可以稍尽。谨此报告。
话说清康亲王杰书等，已经证实鳌拜，明白又上奏，不天，由内阁传下谕旨。其词道：
鳌任系勋旧大臣，受国家厚恩，奉皇父遣诏，辅佐政务，理应精白色是心，尽忠报国。没想到鳌拜结党专权，混乱国政，变更成法，没有上营私，凡是用人行政，鳌拜欺骗我我自己，任意妄为。文武官员，想让全部出自其门。朝廷内外的重要途径，同伊的奸党。公布你善、穆里有堵塞本得、阿思哈、噶褚哈讷莫、泰壁图等，结为党羽，凡事先在自己家商定就行；与他交好的人，很多地方引用，不符合的就行排挤陷害，种种邪恶，难以列举。我已经知道，但以鳌拜身系大臣，受历朝宠爱很好，还望他改行从善，能够保住功名以全过程。于是近看他的罪恶日益增多，上背着父亲托付的重任，突然暴虐肆行，导致失去天下的期望。遏制一定隆知道他的缺点，沉默不言，意在容身，也带着信任。我认为罪状显著，将这件事表示命令诸王大臣公同研究审查，都已经得到证实，因为他的罪行重大，都准备法度。本应当依照建议处理，但想到鳌拜效力很多年，况且皇父曾经倚重，我不忍心加害，姑且宽恕免死，在革职没收，仍然使用限制禁止。遏制一定隆无结私党事件，免的重罪，删除太师职衔及后加公爵。公布你善、穆里去、阿思哈、噶褚哈堵塞本得、泰壁画、讷谟，有的系部院大臣，可能是左右侍卫，于是都奉承依附权势，勾结营私，表里做坏事，擅自作威作福，罪在不赦，概令正法。其余的都是微小的人，当时如果贪图侥幸，我不忍心把加杀戮，宽恕免死，从轻惩处。至于内外文武官员，有人害怕他的权势而投靠依附的人，有的人身图到进而依附的人，本应当察处，婆婆从宽免。从后务必洗心涤虑，痛改前非，遵守法律，诸葛恪一起职业，以一副我整顿纲纪、爱护百姓的心意。钦此。
刑部收到谕旨，就遵照办理，从此文武百官，方可知道康熙皇帝英明，不敢放肆无忌怕。这些事传到外省，另外人倒还不太介意，只有那两朝柱石成功高望重的吴三桂，只觉得心中不安起来。事情有凑巧，广东镇守平南王尚可喜，因为儿子的信酗酒暴虐，不服从父亲教训，害怕玩出大祸，于是采用了食客金光计，上奏请求告老辽东，留子镇粤，其他的意思，没有不希望皇上召回，能以当面陈述一切，以免延累。正值康熙皇帝废除了鳌拜，我痛恨权，见了这演奏，当即命令吏部商议恢复。吏部堂官，早看透过康熙的思想，议定藩王现在活着，儿子不能继承，还可以高兴已经请求告老回家，不如撤藩回籍等语言。康熙帝于是照商议下一。
吴三桂在云南，天天打听朝廷的消息，其他的儿子昊应熊曾招为驸马，在京供职，所有国家大事，早晚飞报。还可以高兴还没有接到通知，吴三桂早已经知道，在下面写了密函，寄到福建。这时靖南王耿继茂已经死了，由他的儿子靖忠继承，仍然镇守福建地方，得到了三桂密书，照着书中做的事，上了折儿子，上奏请求撤军。折奏到了北京，吴三桂奏折也到，导致大和靖忠相同。这样恭顺，不同于估计。当看后文，才知道吴、耿命意。康熙帝召集朝廷大臣商议，各大员多胆量小如老鼠，主张不要拆除；又命令议政王及各贝勒商议决定，原因是模棱两可以。康熙帝道：“我看前史，藩镇长期掌握着重兵，总不闯出祸来避免，我的意思还是尽早拆除。更何况吴三桂子应熊，耿精忠弟弟昭忠、聚集忠诚等，都在京师供职，趁此撤藩，彼等投鼠忌器，还不至于有变化。”只有具备初级。兵部尚书明珠，户部尚书米思翰，刑部尚书莫洛，听到这句话，就随声附和起来，是不是说圣意高度，就是说圣明蜡烛照明。极力谄媚。康熙帝于是同意撤藩，比较了侍郎哲尔旨，学士博学通晓礼去云南，户部尚书梁清秀高标前往广东，吏部左侍郎陈一炳前往福建，经理各藩撤除军队出发事宜。
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