接着齐天大圣孙悟空开始讲起识神是在身体大脑中形成的可以控制生命体行为的主观能动意识的神话别称，生命体从诞生那一刻起就不断地用身体（包括肌肤和神经）和感官接收天地间各种事物的信息能量，包括风云、光影、阴晴、冷暖和声音，在人类生命体中还会不断接受人文事物，特别是大量地接受知识和生活教导，在大脑里积累了很多知识信息和事物信息。大脑具有特殊的生物性信息加工功能，大脑功能与信息能量之间产生能量旋机，形成大脑思维，不断复制、演化、创造和提炼新的信息，使大脑内的信息迅速膨胀，信息能量也随之增大，形成信息能量场，具有能量感应性。这种感应性不断增强，又产生在大脑中，最终与大脑机能一起合成了具有分辨功能和控制身体功能的意识体，这就是识神。
识神是由大脑机能和大脑储存的信息能量决定的，有什么样的大脑机能，有什么样的信息能量储存，就衍生出什么样的识神。动物有动物的识神，人类有人类的识神。人类的大脑机能比动物的大脑机能的生物性能更强更好，故而能吸收的信息能量比动物吸收的种类多、信息量更大，所衍生识神的生物性更高级，识神的意识性和意识力更强。识神无论怎么强，都受到大脑机能和储存信息的制约，人的思想会千差万别，也不会产生超出大脑机能的思维能力，不会产生超越所储存知识信息以外的思维能力，故人的思想必然局限在大脑机能和所储存的知识范围内。识神与大脑机能混成，它是生命体的有机构成，人的情感、欲望等都与识神密切相关，都在识神的作用和控制下发生，故人的识神具有情感和欲望的因素。当人的大脑机能受到损坏时，识神就会随之受到影响；当人脑储存的知识信息发生系统紊乱时，识神同样会发生紊乱。这两种情况是造成人的精神和行为状态异常的根源。当人的生命终结时，大脑机能丧失，人的识神也随着魂魄离体而消失。
两者的的关系
一般情况下，元神只进入人体中。人体的识神产生在大脑中，它能够以意识力控制大脑机能，从而控制身体行为。元神来自于魂魄之外，它是高能灵体，比识神的意识力强大。识神是大脑机能与知识信息合成的，当识神的意识力非常强大时，大脑机能和身体行为完全由识神控制，元神与大脑无法沟通，发挥不了灵性作用。由于元神是高灵意识体，具有灵性，而识神只是意识体，没有灵性，当大脑完全被识神控制时，思维就缺乏灵性。有时候识神活动太累歇息一会儿时，元神得以接触大脑信息并控制大脑，就会发出灵性意识，这就是人们感受到的"灵感"。
修行人转世时元神随胎儿一起来到世间，封闭在身体内，不能直接接触事物，也不懂事物属性，需要通过一定的方式元神才能重新被唤醒且将自修行之世至今的所有一切与今世串联。大脑在积累知识和信息时在大脑中储存一定的知识和信息，在元神没有苏醒前识神控制大脑，由于元神未苏醒而知识和信息太少而出现行为盲然，表现为行为幼稚，识神阻碍甚至控制了元神与大脑的沟通，灵性会减弱甚至丧失，这就是元神会迷失的原因，佛门称之为隔阴之迷。
识神会产生和控制人的情感和欲望，当人的情感和欲望很强烈时，识神会被玄晕，严重时会丧失识神的意识和理性。元神在识神控制大脑和生命行为时，对情感和欲望没有控制力。当元神恢复对大脑和生命行为的控制时，元神有能力控制情感和欲望。元神控制大脑和生命行为的前提条件是不用识神，掌握生命控制权，这需要经过生命修炼才能达到，这就是千年来人类存在生命修炼现象的根本原因。
无极界和有极界通过其相应的元神及识神来进行联系和控制，识神是元神控制的结果。从整个宇宙讲，宇宙是实体，元神是灵体，就具体的人类讲，人体是实体，元神是灵体。宇宙的体系是元神统帅的结果，而形之为个体的形形色色的智体是元神不同层次控制的产物，它是元神的不同表现的缩影。
道家论神为人身“三宝”之一，虽历代医家皆有论述，可气功古籍所载尤详。丹道书中义将其分为先天与后天，先天之神又称“元神”。元，有本无、根本、原始之义。元神是指与生俱来的禀受于先天的神气，与出生后由外景事物为心所任而逐渐产生的后天识神、欲神有着本质的区别。正如张伯端所说：“夫神者，有元神焉，有欲神焉。元神者，乃先天以来“点灵光也；欲神者，乃后人所染气禀之性也”（《青华秘文》）。近人张锡纯也说：“元神者，无思无虑，自然虚灵也；识神者，有思有虑，灵而不虚也”（《医学衷中参西录·人身神明诠》）。
神本原于先天父母之精。《灵枢·本神》说：“生之来，谓之精，两精相搏谓之神。”《灵枢·天年》又说：“血气已和，荣卫已通，五脏已成。神气舍心，魂魄毕具，乃成为人。”意即父母媾精结胎成形之后，神气舍心才产生生命。此神为出生前尚未被后天所染之神，故当指元神而言。正如《性命圭旨全书》所说：“父母媾精之后，一点灵光……元从太虚中来者，我之元神也。”
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